Au Mali, le SG 2000 travaille en collaboration avec le Ministère du développement rural depuis 1996.

La pluviométrie irrégulière, problème récurrent au Sahel, entraîne des variations des rendements sur les parcelles de test de production (PTP), qui sont les dispositifs principaux pour enseigner aux agriculteurs et aux agents de vulgarisation agricole les bases des technologies améliorées.

La dégradation des sols au Mali a suscité un abandon des terres, et actuellement, en raison de la pression démographique, la récupération des terres agricoles abandonnées est devenue une priorité. Avec l'assistance de la Banque mondiale, des actions ont été entreprises pour arrêter l'érosion des sols, en utilisant des cordons pierreux et des digues. "Nous espérons trouver des moyens d'augmenter les rendements sans trop augmenter les coûts de production", commente le Dr Marcel Galiba. "En particulier, nous devons trouver le moyen d'inverser les dommages causés par l'exploitation minière des substances nutritives du sol qui s'est poursuivie pendant plusieurs décennies, et lancer un processus de réhabilitation des sols". Plusieurs centaines de PTP ont été cultivées chaque année pour montrer les avantages résultant de l'application de minerai de phosphate en poudre fine sur les sols, et de l'intégration de légumineuses à graines telles que les arachides, le dolique, l'hibiscus et le sésame dans le système des cultures.

"Il existe de bons systèmes de recherche nationaux au Mali, et nous espérons renforcer encore leurs liens avec les organisations de vulgarisation agricole et de production, et soutenir les essais de culture, sur le site des exploitations, du QPM et d'autres cultivars améliorés".

Les efforts du SG 2000 dans le secteur du maïs sont focalisés sur les plantations hors saison dans les zones irriguées. Le but est de rompre le cycle de culture continue du riz. La variété de maïs protéique de qualité (QPM) Denbanyuman fut introduite au Mali en 1997, à partir du Ghana où elle est connue sous le nom de Obatanpa ("la bonne nourrice"). En 2001, 914 hectares de Denbanyuman ont été plantés dans la ceinture du coton, avec la participation de 150 villages et 1.272 agriculteurs.

Comme les taux de récupération des crédits pour acquisition d'intrants ont été irréguliers, le SG 2000 et ses partenaires ont décidé de limiter les crédits pour acquisition d'intrants aux villages pour lesquels les taux de récupération sont adéquats.

Les associations d'agriculteurs étaient populaires au Mali. 12 associations de crédit furent établies en 1997, selon les lignes directrices des CREP – caisses rurales d'épargne et de prêt – au Bénin et au Togo. L'accent fut d'abord mis sur la mobilisation de l'épargne. Par la suite, des crédits furent aussi accordés, dans le cadre du contrôle et de l'autosuffisance locaux. 655 agriculteurs, dont 270 femmes, sont devenus membres de ces 5 premières CREP. Les dépôts initiaux dépassèrent 4.000 $US. Une année plus tard, les CREP comptaient presque 2.000 membres – dont un quart de femmes – avec un volume d'épargne total de plus de 15.000 $.

En 1998, quelques 6.000 parcelles de démonstration furent plantées, dont 2.000 en maïs, et les 4.000 restantes en sorgho, millet, dolique et arachides. 70 agriculteurs testèrent l'Obatanpa et la variété de maïs protéique normal Sotubaka pour la première fois. Plus de 2.000 kg de semences d'Obatanpa furent produites sous irrigation. Il y a actuellement 13 CREP, dont chacune compte 150 à 500 membres.

En 1999, les chutes de pluie furent abondantes au Mali, ce qui stimula la production agricole dans tout le pays. Quelques 4.900 agriculteurs plantèrent plus de 5.000 PTP. La moitié d'entre elles furent plantées en maïs, suivi du millet, du riz et du sorgho.

Seulement quatre ans après le début du programme, plus de 4.600 agriculteurs finançaient eux-mêmes leurs démonstrations de cultures annuellement, achetant en espèces tous les intrants nécessaires à un réseau de dépositaires ruraux privés.

Le Nalongo, nom local donné au QPM Obatanpa, fut officiellement introduit en novembre 2000. En 2001, 18 tonnes furent plantées sur 750 ha en collaboration avec des associations de cultivateurs de semences et d'entreprises de semences privées.

En partenariat avec l'ICRISAT, la FAO et l'Institut national de recherche, le SG 2000 s'investit dans un projet de crédit-stockage appelé "warrantage" dans 3 villages. Chaque village doit posséder une banque de céréales pour stocker les grains, dont une partie sert de garantie pour l'obtention de crédits pour acquisition d'intrants.

En 2003, Marcel Galiba affirma que "la disponibilité de semences, toutefois, continue à être un goulot d'étranglement majeur qu'il nous faut affronter plus agressivement".

Une tribune nationale fut donnée au QPM lors de la Journée des femmes en mars 2003 à Bamako, au Palais des Congrès où six communes rivalisèrent pour préparer 30 plats différents à base de QPM. La Première dame du Mali, épouse du président Amadou Toumani Touré, était l'invitée d'honneur, et plus de 1.000 femmes participèrent à cette manifestation.

Le SG 2000 a aussi promu les variétés de NERICA dans le pays. En 2002, 500 PTP furent plantées par 315 hommes et 185 femmes dans 87 villages situés dans la ceinture du coton du Mali méridional.

Il fut décidé en 2004 de poursuivre le programme au Mali, dans le but de mener complètement à son terme l'objectif du projet, afin que le pays serve de modèle pour la zone sub-saharienne.