SG2000はエリトリア農業省と協力し、1996年に新しい農作物技術移転プログラムを開始しました。マルコ・キニョーネス氏は1996年、「現時点ではエリトリア国内にSG2000のスタッフはいません。その代わりにエリトリア農業省のスタッフが本プロジェクトを推進しています」と話しています。

エリトリアではGDPの50%を農業が占めています。半乾燥気候のため、生産地の多くは高地に集中しています。穀物生産の40%はソルガムで、農民は伝統的な農法を用いてソルガム、トウジンビエ、シコクビエ、大麦、テフを生産していました。エリトリアは頻繁に食糧不足に陥り、数十万トンもの穀物を輸入していました。

新技術の普及に大きな役割を果たす普及員は、理論と実技両面の研修を受けました。普及員はEMTPを実地体験し、フィールドデーやワークショップに参加しました。SG2000では、普及監督には車両やバイクを支給し、必ずフィールドデーに参加できるようにしました。

1996年には46ヶ村300人近くの農民が、EMTP190ヶ所（トウモロコシ、大麦、小麦、ソルガム、テフ）に参加し、うち10%近くは女性でした。参加農民は、推奨パッケージの購入費用の80%まで融資を受け、収穫後に返済する形を取りました。1996年度の融資返済率は72%でした。返済率が低かったのは小麦およびソルガム生産農家で、降雨が少なかったため収穫高が低かったことが原因でした。

エリトリアのSG2000ディレクター（1998年より）、マルコ・キニョーネス氏は、「エリトリア政府により、現地実証プログラムへの強力な財政支援体制が得られたため、SG2000がエリトリアでの活動を終えたあともずっと、エリトリア農民への進んだ農作技術普及を継続することが現実的に期待できるようになりました」と話しています。
実際、エリトリア政府はSG2000技術移転アプローチを活用し、農民への改良技術普及の意欲的な計画に対し、大々的な支援を行ないました。

1998年には10万人もの農民が、エリトリア政府が財政支援する農業強化プログラムに参加しました。また、SG2000および国際連合食糧農業機関（FAO）も、一部農民の実証圃場設置に資金援助を行ないました。1999年には、エリトリア政府はプログラムを大幅に拡大し、これら規模の倍増を目指しました。

マルコ・キニョーネス氏は1998年、「エリトリア政府は農業開発に熱心に取り組んでおり、農村も新技術導入に非常に熱心です。しかしエリトリアにおける穀物自給率はわずか60〜70%にすぎません。したがって、自給実現にはまだまだ長い道のりがあります」

1998年、エリトリアでは戦争が起こり、プログラムは1999年末に終了を余儀なくされました。エリトリア政府は2000年にSG2000の再開を求めましたが、戦争による政治的緊張の高まりと数々の問題に加え、SG2000の活動国が非常に多くなっていたため、その時点では再開は不可能でした。